纯水/超纯水随着时间的延长而水质下降。
导致水质劣化的原因来自以下几个方面：
储存器:由于纯水中溶解的离子浓度很低甚至没有，这样子纯水极易从外界环境中吸收离子污染物。 低级塑料和玻璃制造的储水器会溶出离子和有机物，增加水的电导率，劣化水质。 因而推荐使用低溶出的高级聚乙烯储水器。
通气口:多数的储水器都有一个排气口用于取水期间空气的流通。通气口吸入外界空气的同时带入实验室空气中的CO2,细菌，颗粒和挥发性有机物。这些都将污染储存在水箱中的纯水。 因而通气口应配置空气过滤器以阻止有机物，细菌和CO2进入水箱。
设计:在清洗过程中，无法将平底水箱的水排干。这些未能排干的水是细菌生长的一个根源。因此我们推荐使用锥形底的水箱以排干所有的水。水箱应采用吹塑成型的方式制作以防止凹 凸不平的表面为细菌提供生长繁殖的场所。
分配:好的分配泵应该在连续工作10个小时的情况下也不会造成温度的升高，温度的升高利于细菌的生长。
消毒:哪怕是极微级的微生物的滋生，也能形成菌膜，劣化水质。所以安装一个能抑制细菌生长的消毒模块（UV灯）是很重要的。
